More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2826 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  93.28 
 
 		 238 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  89.08 
 
 		 238 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  81.51 
 
 		 238 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  80.17 
 
 		 238 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  79.75 
 
 		 238 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  77.31 
 
 		 238 aa  377  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  52.16 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3447  uridylate kinase  55.36 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.345639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  53.19 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2349  uridylate kinase  55.6 
 
 		 240 aa  248  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4437  uridylate kinase  62.5 
 
 		 257 aa  248  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2075  uridylate kinase  55.6 
 
 		 240 aa  248  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.433019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  55.08 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2035  uridylate kinase  56.03 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1538  uridylate kinase  55.6 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0631  uridylate kinase  54.74 
 
 		 240 aa  244  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_004310  BR1160  uridylate kinase  54.66 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  49.58 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1117  uridylate kinase  54.66 
 
 		 323 aa  241  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1133  uridylate kinase  55.13 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2524  uridylate kinase  55.13 
 
 		 240 aa  241  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831867  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3831  uridylate kinase  56.9 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  52.36 
 
 		 236 aa  238  8e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0301  uridylate kinase  57.76 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.06889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  51.49 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  50.64 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  51.27 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  49.78 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  52.38 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  52.38 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  50.85 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  53.22 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  50.85 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  50.22 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  51.5 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  52.79 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  52.79 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  50.42 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  52.38 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  51.07 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  52.38 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1585  uridylate kinase  53.62 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  52.38 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  49.57 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  52.12 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  52.36 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  51.95 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  50.64 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  49.57 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  51.95 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  50 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  51.93 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1778  uridylate kinase  53.62 
 
 		 240 aa  231  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  50 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  51.93 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  51.53 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  51.07 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  51.07 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  51.5 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  50.42 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  50.42 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  48.72 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  50.21 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1383  uridylate kinase  53.22 
 
 		 247 aa  228  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.862612  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  50.21 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  48.74 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  50.22 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  50.21 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  50.64 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  48.29 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  50.64 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  48.29 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  49.79 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  48.31 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  48.51 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  48.32 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  48.29 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  48.29 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  50 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  48.29 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  48.29 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  48.29 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  48.29 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  48.29 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  48.29 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  48.29 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  51.07 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  49.58 
 
 		 237 aa  224  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>