18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2755 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  100 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  53.23 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  43.79 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  40.8 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1786  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  30.81 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  30.3 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  34.59 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  29.8 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  34.4 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  31.62 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2056  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00516688  hitchhiker  0.00129345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3327  amidohydrolase 2  31.17 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>