103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1636 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1636  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.52512  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1047  hypothetical protein  44.35 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0531  hypothetical protein  44.04 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0922777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2986  hypothetical protein  42.55 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309048  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5438  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  34.62 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0896  transposase IS3/IS911 family protein  35 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.665473  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4710  transposase IS3/IS911 family protein  33.65 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4904  transposase IS3/IS911 family protein  33.65 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  32.63 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  28.83 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  28.83 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  34.34 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  32.35 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  35.79 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  35.71 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  35.71 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  35.71 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  28.85 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  28.85 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  29.81 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  29.81 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  29.81 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  31.07 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  31.07 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  31.07 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  31 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  37.66 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  30 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  31.65 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  28.85 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  33 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  31 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  31 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  31 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  32.1 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  32.1 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  36.84 
 
 		 492 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5098  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.451404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  32.1 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  32.22 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2015  transposase IS3/IS911 family protein  33 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  33.73 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  33.68 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3471  hypothetical protein  37.33 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  32.1 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3246  transposase IS3/IS911  34.52 
 
 		 88 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00639582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 		 399 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  35.48 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  30 
 
 		 393 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  31 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  31 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  29.7 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  29.7 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>