More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0946 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 395 aa  783    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  83.04 
 
 		 414 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1767  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.05 
 
 		 395 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000492004  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.78 
 
 		 383 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1273  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.78 
 
 		 397 aa  307  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1246  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.97 
 
 		 393 aa  305  6e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404887  normal  0.363683 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0888  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.96 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.867893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1485  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.593755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.52 
 
 		 396 aa  288  8e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 		 395 aa  283  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.7 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0253  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.93 
 
 		 384 aa  225  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0492  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.12 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0717  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1319  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2661  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 		 380 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2617  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1199  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 380 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0534  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.0000192772 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02634  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003761  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0152546  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0140  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 		 387 aa  172  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24600  predicted protein  32.37 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.37 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.65 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0599  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.155589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.62 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.62 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 		 384 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.79 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.29 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0611  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.59 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.17 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  35.13 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.79 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.13 
 
 		 382 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.53 
 
 		 384 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1552  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.65 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.28 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0198  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.78 
 
 		 386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2279  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 		 374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 		 872 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0423  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 		 873 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  30.56 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0443  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 858 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 		 387 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0755  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 		 872 aa  143  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101238 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4453  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 		 867 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.657364  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.55 
 
 		 405 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4104  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 		 867 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  33.23 
 
 		 386 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 		 397 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4504  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 867 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4115  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 867 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  32.93 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  31.54 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4490  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 867 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 887 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0746  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 		 867 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4451  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 867 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  30.59 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 		 392 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>