60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4735 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  79.03 
 
 		 454 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  79.25 
 
 		 456 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  80.04 
 
 		 454 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  79.56 
 
 		 454 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  93.29 
 
 		 462 aa  786    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 462 aa  917    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  83.19 
 
 		 461 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  74.44 
 
 		 455 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  73.81 
 
 		 447 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  72.63 
 
 		 459 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  72.51 
 
 		 458 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  60.48 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  58.48 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  48.51 
 
 		 473 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  39.13 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  37.56 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  41.63 
 
 		 538 aa  280  6e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  41.58 
 
 		 524 aa  277  4e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  43.47 
 
 		 520 aa  272  9e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  29.58 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  28.61 
 
 		 476 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  34.44 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  29.32 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  24.35 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  34.27 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1074  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4287  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1434  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4373  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 300 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  44.29 
 
 		 298 aa  46.6  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13790  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  22.36 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  38.67 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0995  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  36.49 
 
 		 664 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0519  GTP-binding protein EngA  23.16 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  40.98 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 		 305 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1615  small GTP-binding protein  29.11 
 
 		 213 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  27.54 
 
 		 299 aa  44.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  30.63 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  40.28 
 
 		 313 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  39.36 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  40.58 
 
 		 334 aa  44.3  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  35.38 
 
 		 663 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  30.46 
 
 		 663 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  39.29 
 
 		 299 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1950  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.18 
 
 		 218 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000597271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  35.38 
 
 		 663 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 293 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 303 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  45.07 
 
 		 298 aa  43.5  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  31.43 
 
 		 301 aa  43.5  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  25.15 
 
 		 293 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 		 309 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  32.67 
 
 		 458 aa  43.1  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  40.91 
 
 		 334 aa  43.1  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  43.55 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>