More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4298 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  80.07 
 
 		 306 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  80.07 
 
 		 306 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  80.74 
 
 		 306 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  79.93 
 
 		 304 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  74.24 
 
 		 316 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  72.57 
 
 		 296 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  73.09 
 
 		 296 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  62.07 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  62.07 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  62.07 
 
 		 296 aa  335  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  63.1 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  55.02 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  55.02 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  56.79 
 
 		 306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  56.79 
 
 		 306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  56.79 
 
 		 306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  56.43 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  56.43 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.02 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  55.02 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  55.02 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  55.02 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  55.02 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  57.14 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.8 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.07 
 
 		 310 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  54.01 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  45.09 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  46.15 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  45.7 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  40.7 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  38.65 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.21 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.21 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  39.07 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  39.85 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  40.08 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.08 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  38.94 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  34.28 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  40.81 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  37.87 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  36.49 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  36.49 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  36.49 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  36.49 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  36.49 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  36.49 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  36.49 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.92 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  34.01 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.9 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.37 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  36.16 
 
 		 494 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.62 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  38.51 
 
 		 519 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  36.16 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  33.94 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  35.69 
 
 		 392 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  35.79 
 
 		 392 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  34.69 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  34.69 
 
 		 402 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  34.69 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  30.24 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  30.13 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02859  integral membrane protein  39.13 
 
 		 159 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  34.09 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.62 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.66 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  28.04 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  27.31 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.12 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  25.72 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  29.49 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  28.89 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.67 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  30.33 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  31.68 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.56 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.68 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  27.37 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.72 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  31.68 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  31.68 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>