193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2605 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2605  transposase, putative  100 
 
 		 165 aa  330  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  73.33 
 
 		 365 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2535  transposase, putative  78.23 
 
 		 124 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  38.36 
 
 		 363 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 		 359 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  31.06 
 
 		 362 aa  90.5  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  36.59 
 
 		 363 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  36.59 
 
 		 363 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  35.98 
 
 		 363 aa  89  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  35.98 
 
 		 363 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  35.98 
 
 		 363 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  31.06 
 
 		 362 aa  88.2  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  31.06 
 
 		 362 aa  88.2  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  35.98 
 
 		 363 aa  87.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  34.36 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  31.45 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  36.42 
 
 		 361 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  36.42 
 
 		 361 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  36.42 
 
 		 361 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  36.81 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  36.81 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  36.81 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  36.81 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  36.81 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  36.81 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  35.15 
 
 		 346 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  32.93 
 
 		 364 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  38.27 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 374 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  32.52 
 
 		 363 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  32.52 
 
 		 363 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  32.52 
 
 		 363 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  34.78 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  32.1 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  32.1 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  32.1 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  30.18 
 
 		 363 aa  74.7  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  30.18 
 
 		 626 aa  74.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  33.09 
 
 		 355 aa  74.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0453  remnant of ISRSO5 transposase protein  36.36 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405912 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  36.96 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  36.96 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  30.49 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  36.36 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  36.96 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  36.96 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  32.52 
 
 		 333 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  29.76 
 
 		 370 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  32.32 
 
 		 370 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  32.52 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  30.49 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  30.43 
 
 		 370 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  30.43 
 
 		 370 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  29.76 
 
 		 367 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  29.76 
 
 		 367 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  33.73 
 
 		 365 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  32.73 
 
 		 363 aa  71.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  30.36 
 
 		 362 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  30.36 
 
 		 362 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  35.77 
 
 		 311 aa  71.2  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  30.36 
 
 		 340 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  30.36 
 
 		 362 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  30.36 
 
 		 362 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  35 
 
 		 364 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  31.52 
 
 		 243 aa  70.9  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  32.1 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  32.24 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  32.24 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  33.54 
 
 		 360 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  33.1 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  26.25 
 
 		 357 aa  68.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  26.25 
 
 		 357 aa  68.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  26.25 
 
 		 357 aa  68.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  26.25 
 
 		 357 aa  68.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  26.25 
 
 		 357 aa  68.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  32.32 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  34.15 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.04 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.04 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>