34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1429 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  92.63 
 
 		 312 aa  607  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  71.48 
 
 		 316 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  72.13 
 
 		 314 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  69.9 
 
 		 310 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  71.78 
 
 		 314 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  71.08 
 
 		 314 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  66.56 
 
 		 308 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  73.31 
 
 		 312 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  73.31 
 
 		 312 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  68.39 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  63.67 
 
 		 311 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  67.1 
 
 		 315 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  66.34 
 
 		 315 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  65.81 
 
 		 315 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  66.13 
 
 		 312 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  66.99 
 
 		 315 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  66.56 
 
 		 309 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  65.7 
 
 		 315 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  58.31 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  55.84 
 
 		 343 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  56.17 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  51.53 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  51.7 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  51.03 
 
 		 317 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  48.23 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  52.7 
 
 		 335 aa  312  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  53.33 
 
 		 335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  41.74 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  32.48 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  27.73 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  27.73 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  34.32 
 
 		 431 aa  92.4  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  26.39 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>