More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0968 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



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Alignment on homolog gene

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0691  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.4 
 
 
468 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000631949  unclonable  0.000000000159146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5068  adenosylhomocysteinase  72.88 
 
 
469 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.724438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0460  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.88 
 
 
469 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0968  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
474 aa  988    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0571313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5280  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.82 
 
 
469 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.5 
 
 
469 aa  703    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0534  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.4 
 
 
465 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0414  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.04 
 
 
470 aa  661    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0469  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.41 
 
 
467 aa  722    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.410988  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1448  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  98.31 
 
 
474 aa  977    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03570  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.47 
 
 
465 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0760213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05620  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.46 
 
 
469 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0449  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.88 
 
 
469 aa  706    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5025  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.88 
 
 
469 aa  704    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3043  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.64 
 
 
464 aa  698    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4849  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.31 
 
 
469 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0532  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.71 
 
 
465 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0915  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.02 
 
 
473 aa  838    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.99 
 
 
441 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.77 
 
 
441 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.3 
 
 
437 aa  509  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.02 
 
 
430 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.56 
 
 
438 aa  491  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.68 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.46 
 
 
438 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.33 
 
 
432 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  57.48 
 
 
438 aa  488  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.79 
 
 
438 aa  482  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.67 
 
 
435 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  55.75 
 
 
436 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.48 
 
 
438 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  56.62 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52 
 
 
472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.92 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.2 
 
 
477 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.2 
 
 
479 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  55.13 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.17 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.4 
 
 
472 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.15 
 
 
435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.36 
 
 
442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.4 
 
 
496 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.1 
 
 
476 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.43 
 
 
476 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.51 
 
 
481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.01 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.9 
 
 
470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 
496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.42 
 
 
470 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.49 
 
 
485 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.55 
 
 
476 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.1 
 
 
472 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.02 
 
 
478 aa  445  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  49.9 
 
 
475 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  53.21 
 
 
450 aa  442  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  50.4 
 
 
475 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.7 
 
 
480 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.4 
 
 
476 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.41 
 
 
478 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.5 
 
 
480 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.5 
 
 
472 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50 
 
 
473 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.92 
 
 
474 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  49.02 
 
 
470 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.01 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.4 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.72 
 
 
485 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.41 
 
 
498 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.24 
 
 
467 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.9 
 
 
472 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50 
 
 
473 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.31 
 
 
476 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  48.63 
 
 
476 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.4 
 
 
474 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  49.31 
 
 
485 aa  438  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.53 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.53 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.49 
 
 
464 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.7 
 
 
472 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.53 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.4 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.69 
 
 
472 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 
473 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  48.81 
 
 
485 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.1 
 
 
514 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.61 
 
 
464 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 
473 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.69 
 
 
472 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.7 
 
 
471 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.43 
 
 
469 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.09 
 
 
471 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50 
 
 
471 aa  437  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.89 
 
 
471 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 
473 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.02 
 
 
472 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.358648 
 
 
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NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 
473 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 
471 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 
473 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.59 
 
 
469 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.8 
 
 
473 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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