226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2108 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 126 aa  258  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0169  aspartate alpha-decarboxylase  88.1 
 
 		 126 aa  231  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0182  aspartate alpha-decarboxylase  88.1 
 
 		 126 aa  231  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00439449  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00130  aspartate 1-decarboxylase precursor  63.49 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  63.49 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  63.49 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  63.49 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  62.7 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  62.7 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  62.7 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  63.49 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  62.7 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  63.49 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  63.49 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  63.49 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  66.13 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  63.49 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  62.7 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  61.9 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3067  aspartate alpha-decarboxylase  62.7 
 
 		 126 aa  163  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.439202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  61.11 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  62.7 
 
 		 126 aa  160  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  60.32 
 
 		 126 aa  160  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  61.11 
 
 		 126 aa  159  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  60.32 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  59.52 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  59.52 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62600  aspartate alpha-decarboxylase  61.11 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42730  aspartate alpha-decarboxylase  61.9 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5448  aspartate alpha-decarboxylase  61.11 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  58.73 
 
 		 126 aa  156  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  58.73 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  59.52 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  58.73 
 
 		 126 aa  153  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  58.73 
 
 		 126 aa  153  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  60.34 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  58.73 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  59.2 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  58.73 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  59.2 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0566  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000545672 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  59.2 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  59.2 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  59.2 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  59.2 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 		 137 aa  151  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0887  aspartate alpha-decarboxylase  60.32 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000407278  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  58.4 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0199  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 126 aa  146  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.649486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  56.35 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  55.2 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  53.17 
 
 		 133 aa  143  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  55.2 
 
 		 128 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  55.2 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  58.41 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  52.38 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0673  aspartate alpha-decarboxylase  53.97 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  52.42 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  57.76 
 
 		 120 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3089  aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2688  aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40119  normal  0.0325759 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2041  aspartate 1-decarboxylase  57.94 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  51.69 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  52.94 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  48.72 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  46.88 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  46.83 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  47.62 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  48.78 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  49.12 
 
 		 156 aa  120  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  49.58 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  49.12 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  49.12 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  48.25 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>