212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0500 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  100 
 
 
84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  83.13 
 
 
83 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  81.93 
 
 
83 aa  144  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  42.5 
 
 
80 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  37.66 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  37.66 
 
 
80 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  32.93 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  31.25 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  37.8 
 
 
82 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  43.33 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  45.61 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  43.86 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  30.49 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  36.49 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  35.06 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  40.62 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  30.67 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  47.37 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  42.11 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  34.57 
 
 
82 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  34.57 
 
 
82 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  36.23 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  35.29 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  38.67 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  39.06 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  33.33 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  33.77 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  35.06 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  39.06 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  39.34 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  39.34 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  43.1 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  39.34 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  39.34 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  38.1 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  39.34 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  39.34 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  39.34 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  43.86 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  32.5 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  37.7 
 
 
83 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  39.34 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  39.34 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  43.1 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  34.57 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  34.15 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  34.15 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  43.64 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  41.38 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  41.38 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  41.38 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  41.38 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  41.38 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  41.38 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  41.54 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  49.06 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  41.38 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  37.7 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  39.66 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  43.64 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  39.66 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  39.66 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  37.18 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  39.66 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  39.66 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  39.66 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  39.66 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  39.66 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  39.66 
 
 
79 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  39.66 
 
 
84 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  42.11 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  45.45 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  32 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  32 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  34.43 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  32 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  32 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  42.11 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  34.78 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  33.87 
 
 
83 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  40.35 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  38.6 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  38.6 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  46.81 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  38.6 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  38.6 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  38.6 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  38.6 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0506  BolA family protein  27.78 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  37.18 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1117  BolA-like protein  37.18 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  38.6 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  38.6 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  44.64 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  38.6 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  38.6 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  30.67 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  46.15 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  29.33 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  38.6 
 
 
84 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>