31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4304 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  296  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  98.68 
 
 		 161 aa  293  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  94.08 
 
 		 152 aa  233  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  72.37 
 
 		 152 aa  221  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  87.5 
 
 		 152 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  71.05 
 
 		 152 aa  214  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  75 
 
 		 152 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  60.54 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  59.18 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  51.66 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  39.19 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  43.55 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  39.16 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  37.93 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.61 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  38.03 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  38.03 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  38.03 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  37.32 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  31.69 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  35.21 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  34.27 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  26.49 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  34.72 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.28 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  31.08 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  27.01 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.4 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.75 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  25.17 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>