More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4071 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4071  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
154 aa  313  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.65049  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1646  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  98.05 
 
 
154 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1248  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  98.05 
 
 
154 aa  306  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1208  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  94.16 
 
 
154 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4227  thioredoxin, putative  66.45 
 
 
155 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0895869  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1688  thioredoxin, putative  65.36 
 
 
155 aa  214  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3701  thioredoxin, putative  64.71 
 
 
155 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.304862  decreased coverage  0.000242326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4555  thioredoxin  60 
 
 
154 aa  191  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.5 
 
 
152 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00388895  normal  0.0679013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51930  thioredoxin  59.03 
 
 
154 aa  189  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36790  thioredoxin  63.43 
 
 
156 aa  187  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0915  redoxin domain-containing protein  40.82 
 
 
158 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0011  hypothetical protein  33.61 
 
 
156 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0011  hypothetical protein  33.61 
 
 
156 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2483  redoxin  33.75 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02142  Thioredoxin related protein  33.33 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0646766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  36.07 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.87 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  34.19 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.98 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  35.61 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  34.85 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  35.61 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.03 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.2 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  30.57 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  30.16 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  38.93 
 
 
267 aa  74.7  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  34.09 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  30.77 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  34.85 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  26.24 
 
 
191 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  30.67 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  31.67 
 
 
200 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.56 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  32.28 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  33.61 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.95 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  26.24 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  32.23 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  30.77 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  24.82 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  24.82 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  24.82 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  30.77 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  29.46 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  30.77 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  29.46 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  24.82 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  30.77 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  24.82 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.53 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  30.77 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  25.55 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  28 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  28 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  28 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  28 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  28.06 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  28 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  28 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  29.23 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  31.54 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  26.9 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  25.55 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  26.19 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  29.71 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.77 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  29.66 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.65 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  26.23 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  31.93 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  25.6 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  28.91 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.2 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.94 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  31.53 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.4 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  32.23 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  29.46 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  26.4 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.4 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  28.83 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.4 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  29.09 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  27.48 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.75 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.36 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  28.7 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.03 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  30.97 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  26.45 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  28.23 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2112  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.69 
 
 
376 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278161  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>