More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02142 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02142  Thioredoxin related protein  100 
 
 
168 aa  347  6e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0646766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2483  redoxin  45.45 
 
 
156 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.6 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00388895  normal  0.0679013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4227  thioredoxin, putative  36.59 
 
 
155 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0895869  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36790  thioredoxin  33.33 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4555  thioredoxin  28.03 
 
 
154 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51930  thioredoxin  32.26 
 
 
154 aa  84  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.03 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0915  redoxin domain-containing protein  32.5 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1688  thioredoxin, putative  33.6 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0011  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0011  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  33.9 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1646  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.47 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3701  thioredoxin, putative  32.8 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.304862  decreased coverage  0.000242326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.3 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4071  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.47 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.65049  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1248  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.82 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147736 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  32.61 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1208  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.17 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  28.1 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.52 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.4 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.21 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.6 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  31.43 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  28.65 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  26.87 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  26.87 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  26.87 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  29.93 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  30.22 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  26.87 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  26.87 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  30.66 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  26.12 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  28.65 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  26.4 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.3 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.23 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.61 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0984  thioredoxin  28.57 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  28 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  27.49 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  27.42 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  27.49 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  27.42 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  27.42 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  27.42 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  30.95 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  27.49 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  28.23 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  29.51 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  27.49 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  27.42 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  30.71 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  28.23 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  25.83 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  30.71 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  30.71 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  26.63 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1400  Redoxin domain protein  31.62 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  27.42 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  27.42 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  31.97 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.36 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  26.63 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  30.97 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  24.85 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  25.44 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  28.57 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  30.77 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.93 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  28.46 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  28.46 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.37 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  28.46 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  28.46 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  30.08 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  28.46 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  28.46 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  28.46 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.71 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  26.92 
 
 
202 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.41 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  26.23 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  31.09 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.08 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  29.37 
 
 
183 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  32.52 
 
 
193 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  25.81 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  28.57 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  24.81 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  30.08 
 
 
173 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.35 
 
 
200 aa  61.6  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.72 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>