More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2483 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2483  redoxin  100 
 
 
156 aa  323  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02142  Thioredoxin related protein  45.83 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0646766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  36.29 
 
 
200 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4227  thioredoxin, putative  33.54 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0895869  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1208  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.22 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1248  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.59 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1646  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.96 
 
 
154 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4555  thioredoxin  33.96 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0915  redoxin domain-containing protein  34.92 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51930  thioredoxin  35.34 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0984  thioredoxin  35.14 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.07 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1688  thioredoxin, putative  31.65 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4071  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.75 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.65049  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.37 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00388895  normal  0.0679013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3701  thioredoxin, putative  33.12 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.304862  decreased coverage  0.000242326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36790  thioredoxin  35.34 
 
 
156 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  28.46 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0011  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  27.82 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0011  hypothetical protein  31.69 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  30.37 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.84 
 
 
191 aa  77  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
175 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.45 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  31.3 
 
 
190 aa  70.5  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  30.17 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  27.88 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.78 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  27.38 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  31.06 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.37 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  33.83 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.36 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  30.08 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  26.19 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  26.19 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.85 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.19 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  26.19 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  26.19 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  32.28 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.97 
 
 
409 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  24.71 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  25 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  25 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  25 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  25 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  24.12 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  25 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  25 
 
 
191 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.69 
 
 
191 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  30.15 
 
 
403 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  30.15 
 
 
403 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  30.4 
 
 
211 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  28.21 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.41 
 
 
191 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.51 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  25.29 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
194 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  23.53 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  28.71 
 
 
211 aa  62.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  24.31 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  31.01 
 
 
198 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.52 
 
 
445 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.17 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.47 
 
 
194 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  29.69 
 
 
194 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  29.69 
 
 
194 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.17 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  28.24 
 
 
183 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
191 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  32.79 
 
 
191 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  28.24 
 
 
184 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  32.17 
 
 
268 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  29.69 
 
 
194 aa  61.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  29.77 
 
 
183 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  29.69 
 
 
194 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  34.78 
 
 
179 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  26.61 
 
 
173 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  27.82 
 
 
183 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  23.61 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.87 
 
 
188 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.69 
 
 
194 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  28.24 
 
 
182 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  29.37 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  29.32 
 
 
182 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  29.32 
 
 
182 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  30.28 
 
 
184 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>