21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3736 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  258  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  74.14 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  47.62 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  55.47 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  53.97 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  53.54 
 
 		 146 aa  105  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  45.38 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  63.44 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  46.83 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  41.32 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1040  hypothetical protein  40.57 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.527359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  43.01 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4915  hypothetical protein  51.52 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233012  hitchhiker  0.00000000370476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4858  hypothetical protein  50.76 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.21  hitchhiker  0.0000568872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  36.89 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  39.81 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4736  hypothetical protein  47.62 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  hitchhiker  0.000000837291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  40.78 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4650  hypothetical protein  60.47 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3304  hypothetical protein  55.56 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>