34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2956 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1045    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  78.52 
 
 		 514 aa  851    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  91.21 
 
 		 512 aa  981    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  47.72 
 
 		 507 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  47.52 
 
 		 507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  49.9 
 
 		 506 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  46.89 
 
 		 506 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  48.88 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  48.26 
 
 		 504 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  47.3 
 
 		 505 aa  511  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  47.28 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  46.73 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  48.08 
 
 		 507 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  46.69 
 
 		 503 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  48.08 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  47.27 
 
 		 507 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  46.87 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  47.04 
 
 		 521 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  46.11 
 
 		 503 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  48.17 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  46.61 
 
 		 507 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  39.84 
 
 		 507 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  41.58 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  41.78 
 
 		 507 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  39.37 
 
 		 521 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  40.28 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  36.17 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  54.95 
 
 		 209 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  28.92 
 
 		 521 aa  206  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  28.65 
 
 		 541 aa  196  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  24.02 
 
 		 544 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  23 
 
 		 522 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  21.26 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  21.26 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>