34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2953 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  708    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  95.08 
 
 		 325 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  69 
 
 		 318 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  55.19 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  55.84 
 
 		 312 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  53.87 
 
 		 316 aa  361  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  54.61 
 
 		 308 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  53.9 
 
 		 309 aa  352  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  56.43 
 
 		 312 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  56.43 
 
 		 312 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  57.84 
 
 		 310 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  53.27 
 
 		 315 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  53.27 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  52.43 
 
 		 315 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  53.27 
 
 		 315 aa  345  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  53.27 
 
 		 316 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  52.44 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  52.7 
 
 		 314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  52.44 
 
 		 312 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  52.7 
 
 		 314 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  52.58 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  52.03 
 
 		 314 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  49.53 
 
 		 322 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  49 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  52.44 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  52.12 
 
 		 335 aa  308  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  50 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  51.47 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  42.68 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  35.35 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  35.8 
 
 		 431 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  26.16 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  26.03 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  26.03 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>