37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2725 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  100 
 
 		 288 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  60.51 
 
 		 297 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  60.51 
 
 		 297 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  60.14 
 
 		 298 aa  345  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  59.78 
 
 		 298 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  59.78 
 
 		 298 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  47.64 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  46.3 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  43.64 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  42.01 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  40.07 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  37.45 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  38.04 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  43.33 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  34.02 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  33.33 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  30.07 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  31.88 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.82 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  32.56 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  30.63 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  30.88 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  39.74 
 
 		 152 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  40.95 
 
 		 151 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  26.28 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  27.34 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  25.82 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  24.81 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  24.15 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  38.1 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  26.67 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  27.67 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  25.29 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  23.5 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0486  hypothetical protein  26.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0628681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  27.59 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  28.79 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>