More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2454 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 760 aa  1488    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1234  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  46.06 
 
 		 763 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6248  heavy metal translocating P-type ATPase  46.52 
 
 		 763 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.676922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5860  heavy metal translocating P-type ATPase  44.16 
 
 		 763 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4372  heavy metal translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 763 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4504  heavy metal translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 763 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.500973 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6233  heavy metal translocating P-type ATPase  44.63 
 
 		 737 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8719  heavy metal translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 802 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6169  heavy metal translocating P-type ATPase  47.33 
 
 		 776 aa  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0722  heavy metal translocating P-type ATPase  45.13 
 
 		 759 aa  538  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000328227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3442  putative cation-transporting ATPase  44.53 
 
 		 765 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.913125  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1328  putative cation-transporting ATPase  43.98 
 
 		 764 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1648  heavy metal translocating P-type ATPase  45.24 
 
 		 764 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0284242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3767  heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 		 780 aa  511  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1106  heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 		 774 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1079  heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 		 774 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 		 774 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.167715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  47.26 
 
 		 618 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2249  heavy metal translocating P-type ATPase  49.13 
 
 		 621 aa  478  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4993  heavy metal translocating P-type ATPase  41.8 
 
 		 775 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4621  heavy metal translocating P-type ATPase  47.67 
 
 		 599 aa  459  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1385  heavy metal translocating P-type ATPase  43.01 
 
 		 775 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0387619  normal  0.88801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1303  heavy metal translocating P-type ATPase  48.55 
 
 		 646 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1580  heavy metal translocating P-type ATPase  49.67 
 
 		 626 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4656  heavy metal translocating P-type ATPase  46.42 
 
 		 616 aa  445  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736872  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3027  heavy metal translocating P-type ATPase  47 
 
 		 611 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0917  heavy metal translocating P-type ATPase  42.41 
 
 		 641 aa  428  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1531  heavy metal translocating P-type ATPase  49.38 
 
 		 626 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2012  heavy metal translocating P-type ATPase  47.51 
 
 		 629 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08040  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  44.57 
 
 		 644 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585954  normal  0.130967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4263  heavy metal translocating P-type ATPase  42.74 
 
 		 791 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0323156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0180  heavy metal translocating P-type ATPase  39.17 
 
 		 602 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3593  heavy metal translocating P-type ATPase  49.74 
 
 		 637 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4803  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 762 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457318  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2566  heavy metal translocating P-type ATPase  48.28 
 
 		 642 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0394  heavy metal translocating P-type ATPase  47.56 
 
 		 641 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0240  heavy metal translocating P-type ATPase  42.34 
 
 		 627 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0078  cation transport ATPase  36.73 
 
 		 593 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.365296  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2083  heavy metal translocating P-type ATPase  43.98 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0340  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 		 661 aa  379  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 		 794 aa  360  5e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1826  cation transport ATPase  35.58 
 
 		 630 aa  343  7e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.296097  normal  0.0201631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0933  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 654 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1352  cation transport ATPase  35.98 
 
 		 719 aa  318  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  34.75 
 
 		 734 aa  308  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  36.33 
 
 		 641 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  36.04 
 
 		 679 aa  304  4.0000000000000003e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 		 737 aa  302  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  30.88 
 
 		 833 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  36.45 
 
 		 639 aa  295  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  35.87 
 
 		 656 aa  293  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0009  heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 		 743 aa  292  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220588 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  35.65 
 
 		 651 aa  292  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  35.2 
 
 		 647 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 630 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  35.33 
 
 		 738 aa  290  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  35.9 
 
 		 750 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  34.37 
 
 		 735 aa  288  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 707 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  33.28 
 
 		 628 aa  287  5.999999999999999e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.66 
 
 		 751 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  34.19 
 
 		 735 aa  283  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  35.69 
 
 		 868 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 		 755 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  30.18 
 
 		 620 aa  281  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  32.37 
 
 		 718 aa  281  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  33.21 
 
 		 800 aa  281  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  30.02 
 
 		 712 aa  281  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  34.52 
 
 		 740 aa  280  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  37.43 
 
 		 787 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  31.99 
 
 		 894 aa  279  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  29.63 
 
 		 712 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  29.38 
 
 		 712 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  30.73 
 
 		 641 aa  277  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  30.73 
 
 		 641 aa  277  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  31.57 
 
 		 641 aa  277  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  34.26 
 
 		 639 aa  277  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  30.91 
 
 		 641 aa  277  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  30.73 
 
 		 641 aa  276  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  30.73 
 
 		 641 aa  276  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 		 823 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  31.35 
 
 		 641 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1348  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 643 aa  275  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0452174  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  33.88 
 
 		 846 aa  275  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  34.76 
 
 		 670 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  36.45 
 
 		 823 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  32.27 
 
 		 799 aa  274  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  35.04 
 
 		 736 aa  274  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  31.93 
 
 		 799 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  30.37 
 
 		 641 aa  273  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  30.37 
 
 		 641 aa  273  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  30.55 
 
 		 641 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5391  heavy metal translocating P-type ATPase  34.3 
 
 		 660 aa  273  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24490  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  35.14 
 
 		 667 aa  273  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0505  heavy metal translocating P-type ATPase  34.3 
 
 		 660 aa  273  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5411  heavy metal translocating P-type ATPase  34.3 
 
 		 660 aa  273  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 		 689 aa  272  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  33.73 
 
 		 1022 aa  272  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20930  heavy metal translocating P-type ATPase  31.49 
 
 		 745 aa  272  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000162182  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  31.49 
 
 		 645 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>