194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1852 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  93.79 
 
 		 145 aa  266  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  93.1 
 
 		 145 aa  262  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  92.41 
 
 		 145 aa  259  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  66.19 
 
 		 146 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  69.57 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  69.34 
 
 		 145 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2244  membrane protein-like protein  65.93 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0054372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  62.41 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28510  hypothetical protein  63.45 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2487  hypothetical protein  63.24 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4193  membrane protein-like protein  60.74 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5166  membrane protein  64.6 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3715  membrane protein-like protein  60.74 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5610  SNARE associated Golgi protein  62.96 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3220  membrane protein-like protein  58.52 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4069  membrane protein-like  58.52 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4297  membrane protein-like protein  58.52 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  57.78 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  56.3 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  55.24 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3229  transmembrane protein  54.62 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588156  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3649  membrane protein-like protein  62.75 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2405  hypothetical protein  52.99 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  51.49 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0190  uncharacterized membrane-associated protein  48.18 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01067  membrane protein-like protein  50.4 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0933  transmembrane protein  53.72 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.590035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2259  transmembrane protein  53.28 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.867153  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2237  membrane protein-like protein  54.64 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.564662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0287  hypothetical protein  50.86 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2147  putative integral membrane protein  43.51 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.864762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1381  membrane protein-like protein  42.66 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1466  hypothetical protein  39.42 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3328  SNARE associated Golgi protein  41.55 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3561  hypothetical protein  42.96 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0353  hypothetical protein  43.8 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  40.27 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6818  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1327  hypothetical protein  39.44 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0199997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2017  hypothetical protein  39.85 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0715199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3262  hypothetical protein  40.14 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.175834  normal  0.086413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1130  hypothetical protein  40.14 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1070  hypothetical protein  40.85 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1056  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1029  hypothetical protein  40.14 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0020  SNARE associated Golgi protein  48.51 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3064  hypothetical protein  40.85 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2982  hypothetical protein  40.14 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1034  hypothetical protein  35.92 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1096  hypothetical protein  40.14 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0381  SNARE associated Golgi protein  45.52 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3162  hypothetical protein  39.86 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  43.28 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002528  hypothetical protein  39.86 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0345  hypothetical protein  45.26 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141714  hitchhiker  0.00000000000399194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1779  SNARE associated Golgi protein  44.35 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.380295  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0641  inner membrane protein  41.3 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4633  hypothetical protein  39.1 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02544  conserved inner membrane protein  43.48 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0995  conserved hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000205167  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02509  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0129195  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3935  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.809511 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1018  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0859423  hitchhiker  0.00416875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2825  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2811  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000161283  hitchhiker  0.000505734 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2972  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000189151  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0986  hypothetical protein  36.69 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000995466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3169  hypothetical protein  43.88 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0441375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1579  hypothetical protein  39.44 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3187  hypothetical protein  42.75 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000058062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03488  hypothetical protein  37.76 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0493  hypothetical protein  42.64 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2910  hypothetical protein  40.29 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0487  putative transmembrane protein  39.31 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.528398  normal  0.0272623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1561  hypothetical protein  37.91 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0846  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797425  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3361  hypothetical protein  36.72 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3021  hypothetical protein  43.55 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0161641  hitchhiker  0.00000846709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2938  hypothetical protein  43.55 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000195475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2969  hypothetical protein  43.55 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0101702  hitchhiker  0.00077012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3004  hypothetical protein  43.55 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.055399  hitchhiker  0.00004287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0892  hypothetical protein  39.84 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1129  hypothetical protein  38.28 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0566076  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3548  membrane protein-like protein  39.71 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3614  membrane protein-like protein  38.97 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3878  hypothetical protein  40.43 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3208  hypothetical protein  38.69 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000592602  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3128  hypothetical protein  42.74 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  normal  0.0197186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1001  hypothetical protein  41.67 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0535  putative transmembrane protein  38.76 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3587  hypothetical protein  37.41 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0328  putative transmembrane protein  36.53 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1119  hypothetical protein  38.69 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000563823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3370  hypothetical protein  41.01 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000974791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3235  hypothetical protein  41.01 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000052813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0892  hypothetical protein  41.01 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000438982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0343  hypothetical protein  36.53 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3029  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>