22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1743 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1743  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 170 aa  357  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3296  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  63.91 
 
 		 170 aa  224  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2903  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  50.53 
 
 		 203 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188915  normal  0.371774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4113  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  48.4 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2973  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  50.9 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2603  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  49.11 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369412  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2606  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  46.2 
 
 		 193 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00071357  unclonable  3.49737e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2640  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  46.2 
 
 		 193 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0502424  hitchhiker  0.00410144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  32.77 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  45.07 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  35.51 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  35.51 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  32.94 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  34.95 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  31.5 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  32 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  30.71 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  29.77 
 
 		 145 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  28.34 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  30.77 
 
 		 205 aa  40.8  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>