44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2211 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  63.29 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  70.06 
 
 		 210 aa  260  8.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  58.96 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  52.6 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  36.61 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  38.81 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  35 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  39.11 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  38.76 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  39.11 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  35.63 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  41.21 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  39.78 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  40.27 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  36.93 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  45.04 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  36.93 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  42.95 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  45.24 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  37.64 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  37.58 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  39.6 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  35.03 
 
 		 242 aa  94.7  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  40.72 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  43.55 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  45.08 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  31.21 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  35.78 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  44.26 
 
 		 244 aa  89  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  38.1 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  41.8 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  41.8 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  38.3 
 
 		 414 aa  82.4  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  34.22 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  38.3 
 
 		 414 aa  81.3  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  40.98 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  35.95 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  34.09 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  29.47 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  32.4 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  35.53 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  37.41 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  32.24 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>