44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2124 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  100 
 
 		 117 aa  237  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  67.52 
 
 		 117 aa  167  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  67.52 
 
 		 117 aa  166  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  59.29 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  44.74 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1910  hypothetical protein  50.52 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  38.26 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  36.21 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  36.75 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0913  hypothetical protein  37.86 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  36.11 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  36.61 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  31.9 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  35.77 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  42.03 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  30.19 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  32.04 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  30.48 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1917  hypothetical protein  36.54 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000207815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  32.41 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  32.41 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  27.52 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  32.04 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  27.52 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3492  protein of unknown function DUF891  33 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.603175  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  27.52 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  32.41 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  27.62 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  27.62 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  26.61 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  26.61 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  39.29 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  30.77 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  28.57 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  30.61 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0589  hypothetical protein  47.62 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  27.19 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  29.79 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1385  hypothetical protein  48.94 
 
 		 68 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  27.08 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  41.51 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  41.51 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  31.31 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>