35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1180 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  100 
 
 		 91 aa  186  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.05 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  39.33 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  35.63 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  31.46 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  32.58 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  32.56 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.71 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.58 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.58 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.58 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.58 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  32.58 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  31.11 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.46 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.97 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  29.89 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  26.97 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  31.46 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  31.03 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  35.14 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  31.94 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4386  hypothetical protein  32.88 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 94 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  28.89 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  28.41 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  34.15 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  30.86 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.95 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>