34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0880 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0880  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  100 
 
 		 181 aa  378  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1695  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  93.37 
 
 		 183 aa  358  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.405257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0860  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  93.37 
 
 		 181 aa  356  9e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0567  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  92.27 
 
 		 181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1160  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  92.82 
 
 		 181 aa  354  2.9999999999999997e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0813  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  92.82 
 
 		 181 aa  354  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000103228  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0527  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  92.27 
 
 		 181 aa  352  2e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0941976  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0433  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  91.16 
 
 		 181 aa  352  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1029  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  90.61 
 
 		 181 aa  346  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1809  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  86.74 
 
 		 181 aa  337  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0705  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  86.19 
 
 		 181 aa  334  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1314  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  64.64 
 
 		 181 aa  248  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555968  normal  0.0182689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1878  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  66.1 
 
 		 180 aa  245  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1176  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  65.36 
 
 		 180 aa  244  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.760156  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1537  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  60.67 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0318772  unclonable  9.142679999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1944  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  59.78 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.550989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2150  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  63.69 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0113  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  60.34 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1025  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  58.76 
 
 		 180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0470482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0500  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  57.14 
 
 		 181 aa  217  8.999999999999998e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2492  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  54.75 
 
 		 181 aa  207  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.595075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1870  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  55.31 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1180  arginine decarboxylase  50.83 
 
 		 183 aa  200  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0203  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  45.25 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0705303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2039  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  44.63 
 
 		 165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696775  normal  0.231662 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0872  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  34.09 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0487  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  33.04 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0124659  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0604  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  26.85 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0667  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  30.5 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.838266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0886  Pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  32.46 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000475255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0894  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  26.85 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1088  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  25.93 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.67804  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1827  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  25 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0829  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  24.07 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.991079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>