20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0957 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  32.8 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  32.67 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  30.2 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  33.1 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  31.79 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  27.89 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1086  hypothetical protein  24.14 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  28.67 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  26.95 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  29.94 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  25.79 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  27.78 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  27.1 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  23.61 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0611  hypothetical protein  27.92 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.895734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  24.88 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  23.65 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3235  hypothetical protein  25.89 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.3467  normal  0.937712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>