25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0347 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  54.55 
 
 		 237 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  51.37 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  44.72 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  48.13 
 
 		 241 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  48.52 
 
 		 244 aa  168  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  46.45 
 
 		 218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  42.78 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  43.32 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  42.42 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  38.07 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  36.6 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  40.4 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  37.11 
 
 		 255 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  35.94 
 
 		 254 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  34.97 
 
 		 256 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  33.71 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  32.46 
 
 		 248 aa  89  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  38.82 
 
 		 251 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  37.87 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  36.09 
 
 		 250 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  31.15 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  33.57 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  32.87 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>