More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0340 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0340  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
314 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.534291  normal  0.0701181 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2285  glycosyl transferase family protein  52.12 
 
 
323 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2849  glycosyl transferase family protein  50.16 
 
 
332 aa  329  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2789  glycosyl transferase family 2  48.4 
 
 
312 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.959212  normal  0.28387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3328  glycosyl transferase family 2  48.4 
 
 
312 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1144  glycosyl transferase family 2  44.01 
 
 
362 aa  297  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000527069  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10440  glycosyl transferase  42.07 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1143  glycosyl transferase family 2  40.89 
 
 
312 aa  264  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0240077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4007  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848988  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  35.99 
 
 
333 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
311 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
311 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
312 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
324 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.97 
 
 
323 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.97 
 
 
323 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  33.97 
 
 
323 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  33.97 
 
 
323 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
347 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4081  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
319 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.869722  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  33.65 
 
 
323 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
366 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
364 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  34.74 
 
 
330 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  31.49 
 
 
319 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  34.09 
 
 
330 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 
341 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
336 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
310 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
336 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
322 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
330 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  33.33 
 
 
320 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 
350 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  30.42 
 
 
365 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 
335 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0613  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
332 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.258074 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
334 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
365 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
365 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
330 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  31.58 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
309 aa  172  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
342 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
359 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
357 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
340 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
307 aa  169  6e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
319 aa  169  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  30.32 
 
 
358 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  32.17 
 
 
319 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
319 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
320 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  33.22 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  32.45 
 
 
367 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  33.54 
 
 
324 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
358 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.23 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2381  glycosyltransferase, group 2 family protein  32.47 
 
 
313 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  31.53 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  31.37 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  31.37 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  31.27 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.26 
 
 
332 aa  162  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.49 
 
 
319 aa  161  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  31.72 
 
 
308 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
312 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
335 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  31.72 
 
 
308 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  31.41 
 
 
312 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
320 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
339 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
341 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
360 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  31.17 
 
 
353 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  32.57 
 
 
343 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
332 aa  159  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
334 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  31.39 
 
 
308 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
356 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.64 
 
 
308 aa  159  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
312 aa  158  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.87 
 
 
353 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.87 
 
 
353 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.87 
 
 
353 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1582  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
327 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
664 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  32.47 
 
 
347 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
383 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
347 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
383 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>