More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3534 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  100 
 
 		 295 aa  597  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  73.93 
 
 		 295 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  73.67 
 
 		 295 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  73.99 
 
 		 297 aa  418  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  73.02 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  72.26 
 
 		 279 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  70.04 
 
 		 287 aa  401  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  64 
 
 		 285 aa  363  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  64.42 
 
 		 285 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  63.47 
 
 		 285 aa  358  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  62.77 
 
 		 277 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  61.99 
 
 		 277 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  61.9 
 
 		 277 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  62.41 
 
 		 276 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  61.25 
 
 		 277 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  62.13 
 
 		 291 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  61.01 
 
 		 287 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  61.68 
 
 		 276 aa  348  8e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  61.25 
 
 		 277 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  62.73 
 
 		 274 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  62.73 
 
 		 274 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  60.65 
 
 		 284 aa  335  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  61.09 
 
 		 280 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  61.99 
 
 		 274 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  61.09 
 
 		 276 aa  331  9e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  57.66 
 
 		 276 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  59.27 
 
 		 279 aa  328  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  56.88 
 
 		 297 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  56.12 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  56.04 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  56.47 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  56.83 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  55.91 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  56.43 
 
 		 304 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  56.23 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  55.63 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  55.63 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  55.63 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  56.27 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  56.74 
 
 		 293 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  56.74 
 
 		 293 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  56.74 
 
 		 293 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  56.74 
 
 		 293 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 		 293 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  55.72 
 
 		 281 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  56.03 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  56.03 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  54.28 
 
 		 286 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  50 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  49.45 
 
 		 274 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  52.33 
 
 		 276 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  48.83 
 
 		 543 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.25 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.81 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  48.44 
 
 		 543 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5509  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  47.5 
 
 		 347 aa  245  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.78 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  43.17 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  46.44 
 
 		 278 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2573  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.74 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0452  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1864  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.34 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429685  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4393  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4234  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 338 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2264  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  47.74 
 
 		 333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4733  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 338 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4246  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  48.38 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0024  oligopeptide transporter ATP-binding component  45.02 
 
 		 348 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.586703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 		 357 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 		 353 aa  238  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4407  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.89 
 
 		 329 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 329 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2723  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.66 
 
 		 324 aa  235  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  0.451475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1243  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.46 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143149  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0234  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.48 
 
 		 351 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003660  oligopeptide transport ATP-binding protein OppD  45.02 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 539 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3627  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.02 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1883  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.72 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  45.16 
 
 		 333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0687438  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1102  ABC transporter related  46.15 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1848  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.84 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.980992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0313  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.89 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2451  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.66 
 
 		 326 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.69 
 
 		 671 aa  232  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.24 
 
 		 347 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3854  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.95 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.403514  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.52 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4731  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.14 
 
 		 711 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1733  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.69 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 		 338 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.84 
 
 		 329 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.66 
 
 		 340 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0355569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>