More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1861 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
252 aa  527  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  84.06 
 
 
253 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  73.71 
 
 
267 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  73.71 
 
 
267 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  71.31 
 
 
253 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  72.91 
 
 
267 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  67.2 
 
 
276 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  65.08 
 
 
255 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  64.29 
 
 
256 aa  363  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  61.54 
 
 
255 aa  346  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  55.06 
 
 
255 aa  310  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  44.63 
 
 
265 aa  218  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  44.26 
 
 
259 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  35.17 
 
 
264 aa  141  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  31.38 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  34.76 
 
 
302 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  33.8 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
307 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  32.88 
 
 
466 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  30.54 
 
 
306 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  28.57 
 
 
304 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  29.41 
 
 
304 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  29.41 
 
 
304 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  35.35 
 
 
463 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  28.21 
 
 
241 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  29.29 
 
 
304 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  28.87 
 
 
304 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  33.18 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  30.23 
 
 
252 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
250 aa  95.1  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  30.73 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  30.52 
 
 
597 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  29.12 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.71 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  31.75 
 
 
449 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  32.37 
 
 
236 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3842  protein serine/threonine phosphatase  29.9 
 
 
262 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104123  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
280 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  34.03 
 
 
250 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  33.65 
 
 
421 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  31.14 
 
 
548 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  31.05 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  30.42 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 
304 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  32.22 
 
 
250 aa  92  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  32.22 
 
 
250 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  30.57 
 
 
241 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  31.48 
 
 
242 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  30.33 
 
 
477 aa  92  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.63 
 
 
239 aa  92  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.58 
 
 
242 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  28.45 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  27.27 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  31.22 
 
 
462 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  32.19 
 
 
389 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  31.02 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  32.34 
 
 
394 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  31.22 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  30.81 
 
 
296 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.49 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  31.48 
 
 
242 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  27.5 
 
 
300 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  30.63 
 
 
304 aa  90.1  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  32.88 
 
 
479 aa  89.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  33.18 
 
 
500 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.5 
 
 
300 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  32.11 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  30.8 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  31.16 
 
 
305 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  29.86 
 
 
567 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  30.84 
 
 
519 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  31.8 
 
 
250 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  31.8 
 
 
250 aa  89  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  31.8 
 
 
250 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  34.53 
 
 
474 aa  89  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  31.8 
 
 
250 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  31.8 
 
 
250 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  31.45 
 
 
252 aa  89  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  30.7 
 
 
313 aa  89  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  31.53 
 
 
284 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  50.59 
 
 
279 aa  88.6  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0544  protein serine/threonine phosphatases  31.6 
 
 
291 aa  88.6  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  28.4 
 
 
386 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  30.43 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  28.97 
 
 
472 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  30 
 
 
558 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  31.16 
 
 
554 aa  87.8  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  32.87 
 
 
369 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  29.95 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.05 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  29.18 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  33.18 
 
 
505 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  27.38 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4063  protein serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 
255 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000181266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  29.74 
 
 
443 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  31.16 
 
 
276 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 
574 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  30.52 
 
 
422 aa  85.9  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.7 
 
 
611 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>