More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1576 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1576  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
136 aa  267  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.717654  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1447  HesB/YadR/YfhF  68.18 
 
 
135 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1406  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.35 
 
 
134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7775  HesB/YadR/YfhF-family protein  54.41 
 
 
132 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7744  HesB/YadR/YfhF-family protein  54.41 
 
 
132 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3644  HesB/YadR/YfhF-family protein  56.48 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0206  HesB/YadR/YfhF family protein  52.07 
 
 
127 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.178163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5902  putative iron-sulfur cluster assembly protein  55.67 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316321  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1065  HesB/YadR/YfhF  46.15 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0398  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.48 
 
 
118 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770041  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0961  HesB/YadR/YfhF  45.69 
 
 
118 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5109  HesB/YadR/YfhF-family protein  41.88 
 
 
118 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4470  HesB/YadR/YfhF  43.93 
 
 
118 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0113  HesB/YadR/YfhF-family protein  46.39 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1531  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.25 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.182474  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.25 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  37.5 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.64 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  41.88 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  36.63 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  39.5 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.98 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  41.25 
 
 
106 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.26 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  39.09 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.27 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.04 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.62 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.62 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.19 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.09 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  42.31 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.09 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.19 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  38.46 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  33.65 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.63 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2053  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.45 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.432369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2134  hypothetical protein  36.45 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.191156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.91 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  36.44 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.79 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.91 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.65 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  37.74 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.89 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  36.9 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.65 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  35.4 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  35.4 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  38.83 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  34.51 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1441  HesB/YadR/YfhF, Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  38.83 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0666522  hitchhiker  0.00534365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.94 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.63 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  33.04 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.91 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.95 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.65 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.79 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  34.65 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  36.89 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.29 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2144  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  36.89 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.78 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  36.63 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00747  HesB protein family  35.19 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.521174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2869  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.86 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.586009  hitchhiker  0.0000000184682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  37.86 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  35.58 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.46 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  38.83 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.11 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.89 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  33.66 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  36.54 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.54 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  30.69 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.96 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.96 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.94 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.26 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  36.94 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>