36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0994 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  281  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  70 
 
 		 110 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  71.96 
 
 		 110 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  56.25 
 
 		 113 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 113 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 113 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 113 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  54.95 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  34 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  34 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  43.08 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 		 92 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  31.4 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  38.1 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  38.1 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  34.72 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  32.76 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  41.51 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  32.76 
 
 		 96 aa  42  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>