More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0325 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0325  ribosomal protein L19  100 
 
 		 119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  62.18 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  62.18 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  57.63 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0651  50S ribosomal protein L19  59.32 
 
 		 115 aa  127  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  55.83 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1018  50S ribosomal protein L19  54.17 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00624649  normal  0.659291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 116 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  60.36 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  57.98 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  56.03 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  56.03 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  56.78 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1295  50S ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.816145 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1395  50S ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.021497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1489  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1521  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.309648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  53.39 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  54.63 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  49.58 
 
 		 118 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0969  50S ribosomal protein L19  50.83 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  52.59 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  48.31 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  52.99 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1738  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0339925 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  49.58 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  50.83 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  50.42 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3364  50S ribosomal protein L19  51.69 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  52.99 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  52.1 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  52.1 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  50 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  54.24 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  50.85 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  56.48 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  55.08 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  50.42 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  55.08 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  54.7 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  50 
 
 		 120 aa  110  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  49.14 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  56.6 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0680  50S ribosomal protein L19  50.45 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  50 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  51.72 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 114 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  52.54 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>