19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0086 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  100 
 
 
168 aa  344  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  40.24 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  40.85 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  31.76 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1223  hypothetical protein  33.99 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.389238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  26.85 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  25.45 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  27.4 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  26 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.28 
 
 
1011 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.28 
 
 
1011 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
284 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  23.53 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  25.97 
 
 
1008 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  23.78 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  26.25 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  23.61 
 
 
150 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  24.68 
 
 
151 aa  41.2  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  27.07 
 
 
279 aa  40.8  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>