More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3276 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 245 aa  471  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  80 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  80.41 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 		 261 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  68.31 
 
 		 257 aa  291  7e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  66.26 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  64.9 
 
 		 257 aa  288  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  60.39 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  61.89 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  62.45 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.52 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.32 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.12 
 
 		 255 aa  275  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  59.59 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  62.55 
 
 		 253 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  63.89 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  64.34 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  63.89 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  63.89 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  60.25 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  61.48 
 
 		 252 aa  258  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  66.12 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.23 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  64.22 
 
 		 292 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  67.98 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  63.31 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  67.27 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460617 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  53.09 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  56.34 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  56.73 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 265 aa  224  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  60.25 
 
 		 262 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.65 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 		 289 aa  155  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.65 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  38.56 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  37.19 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.85 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.55 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.2 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.38 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  41.85 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  41.85 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  41.85 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  41.1 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.18 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.55 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.5 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  37.71 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 266 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  34.27 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.27 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  34.27 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  34.27 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  34.27 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.55 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  34.03 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  34.03 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  35.15 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  34.03 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  34.03 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  42.05 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  35.15 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.66 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.47 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.75 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  33.47 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  35.15 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  33.47 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.76 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  33.47 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  33.47 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.12 
 
 		 297 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  39.27 
 
 		 261 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.12 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  38.74 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  33.47 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>