44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2369 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  308  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  78.23 
 
 		 163 aa  236  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  83.87 
 
 		 156 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  78.95 
 
 		 166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  78.81 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  67.76 
 
 		 156 aa  204  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  67.81 
 
 		 163 aa  191  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  64.14 
 
 		 188 aa  180  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  64.14 
 
 		 188 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  59.09 
 
 		 170 aa  171  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  81.98 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  63.19 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  48.57 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  48.18 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  48.92 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1574  hypothetical protein  60.99 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00494576  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  42.57 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  48.39 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  45 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  44.52 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  45.86 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  39.04 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  39.04 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  35.61 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  35.16 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  34.21 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  35.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  33.61 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  29.93 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  29.93 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  30.39 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  32.52 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  28.24 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  29.1 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  28.21 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  32.73 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  28.12 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  29.66 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  26.12 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  28.87 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  28.99 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  28.89 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  26.85 
 
 		 138 aa  42  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>