25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2138 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  269  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  32.11 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  35.51 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  31.03 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  27.73 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  35.51 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  35.51 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  27.73 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  31.78 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  29.7 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  31.68 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  28.97 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  25.42 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  32.61 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  27.85 
 
 		 136 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  26.73 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  29.13 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  27 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  28.44 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  24.56 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  40  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>