43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1947 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  494  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  76.72 
 
 
276 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  65.11 
 
 
264 aa  284  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  66.41 
 
 
262 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  65.11 
 
 
282 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  66.67 
 
 
339 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  65.53 
 
 
261 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  58.27 
 
 
275 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  41.7 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  41.49 
 
 
267 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  41.49 
 
 
267 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  66.67 
 
 
662 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0671  hypothetical protein  60 
 
 
211 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0981085  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  33.9 
 
 
287 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  41.24 
 
 
108 aa  82  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.4 
 
 
2798 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  27.57 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28.82 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  32.68 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  32.31 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  30.74 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.77 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  32.02 
 
 
258 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  30.7 
 
 
121 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  28.27 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.85 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  31.09 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  31.25 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  29.86 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  31.55 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.66 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  28.95 
 
 
273 aa  43.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  26.96 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  30.25 
 
 
265 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  34.18 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  28.83 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  30.19 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  23.26 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.12 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  32.14 
 
 
243 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  29.31 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  28.12 
 
 
274 aa  42  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>