26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1808 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1808  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0459623  normal  0.163421 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1798  XRE family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 135 aa  137  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.853866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2712  transcriptional regulator, XRE family  59.09 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1480  transcriptional regulator, XRE family  52.48 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1519  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37865  normal  0.680818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4822  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.29 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246959  normal  0.144196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1851  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4943  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.505342 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0490  Fis family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3491  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2419  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.21 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  36.05 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 503 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  37.14 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 68 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 256 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0351  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.94 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.598178  normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0938  helix-turn-helix domain-containing protein  23.91 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>