More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1341 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
323 aa  657    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  93.5 
 
 
327 aa  622  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  91.64 
 
 
323 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  89.78 
 
 
327 aa  598  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.38 
 
 
323 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  89.62 
 
 
317 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.38 
 
 
331 aa  567  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.31 
 
 
316 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.41 
 
 
316 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.1 
 
 
316 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
316 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.9 
 
 
322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
314 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
309 aa  355  5e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 
325 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.33 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
314 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.48 
 
 
313 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.21 
 
 
309 aa  350  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.12 
 
 
316 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
319 aa  348  6e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.54 
 
 
309 aa  348  7e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.68 
 
 
309 aa  348  9e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.21 
 
 
309 aa  348  9e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.16 
 
 
321 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.83 
 
 
319 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.54 
 
 
309 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.21 
 
 
309 aa  346  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 
338 aa  346  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
319 aa  345  6e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
321 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
316 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.7 
 
 
311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
321 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
321 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  53.55 
 
 
313 aa  342  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  342  7e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
338 aa  341  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.34 
 
 
318 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.34 
 
 
318 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  56.55 
 
 
327 aa  340  1e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
314 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 
330 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
331 aa  339  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
318 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
314 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.53 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.19 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
309 aa  335  7.999999999999999e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
315 aa  334  9e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
325 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
359 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
320 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
314 aa  334  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
320 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.69 
 
 
317 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.57 
 
 
311 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
330 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
315 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
315 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
315 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
320 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
318 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  54.69 
 
 
312 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
320 aa  332  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  6e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  6e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
313 aa  331  9e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.62 
 
 
313 aa  331  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.34 
 
 
315 aa  330  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  330  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
317 aa  330  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.25 
 
 
308 aa  330  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
328 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.16 
 
 
310 aa  329  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2923  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
313 aa  329  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.16 
 
 
310 aa  329  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
314 aa  329  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
316 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
320 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
320 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 
323 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.87 
 
 
329 aa  328  7e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
320 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>