84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2433 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2433  protein of unknown function DUF971  100 
 
 
102 aa  213  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0839249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  55.84 
 
 
109 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  45.16 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  43.01 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  43.01 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  44.26 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  37.5 
 
 
438 aa  58.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  30.69 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  29.59 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  31.91 
 
 
117 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  31.18 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  32.67 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  29.17 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  28.12 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  29.17 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  32.98 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  29.17 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  29.17 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  29.17 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  29.17 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  32.98 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  32.98 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  31.18 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  29.17 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  29.17 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  29.17 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  28.09 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  53.85 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  31.18 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  31.18 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  31.18 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  31.18 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  31.18 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  32.98 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  29.79 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  30.21 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  29.17 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  43.75 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  29.17 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  29.79 
 
 
123 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  30.85 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  29.9 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  28.12 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  26.04 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  51.52 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66800  hypothetical protein  27.66 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  28.12 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2580  hypothetical protein  28.74 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  42.5 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  27.96 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  27.08 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  27.96 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  26.04 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  28.09 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  27.96 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  28.12 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  25 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  26.04 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  43.24 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1898  hypothetical protein  28.09 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.32912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  28.57 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  26.04 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0780  hypothetical protein  24.73 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  23.66 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  26.88 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  23.66 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3766  hypothetical protein  28.28 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000239528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  26.04 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  53.12 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  29.79 
 
 
106 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  30.61 
 
 
92 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  22.34 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0220  protein of unknown function DUF971  30.43 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.635086  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  32 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  27.17 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  25.81 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  39.22 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  29.59 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  29.59 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  29.59 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0528  hypothetical protein  53.57 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  48.39 
 
 
120 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  32.81 
 
 
130 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>