35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2339 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 638 aa  1291    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  29.51 
 
 		 396 aa  124  7e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  25.7 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  22.85 
 
 		 360 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  25.06 
 
 		 453 aa  67  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  24.39 
 
 		 382 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  23.58 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  23.56 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  29.17 
 
 		 625 aa  56.2  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  28.69 
 
 		 701 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  22.96 
 
 		 480 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  24.07 
 
 		 389 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  35.25 
 
 		 704 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  22.57 
 
 		 397 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  23.85 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  26.13 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  29.41 
 
 		 763 aa  51.6  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  29.41 
 
 		 787 aa  51.6  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 788 aa  51.2  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1334  FMN-binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 705 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.461369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 749 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  23.02 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  27.36 
 
 		 743 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  34.38 
 
 		 719 aa  48.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  27.27 
 
 		 764 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  25.98 
 
 		 431 aa  47.4  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  29.72 
 
 		 764 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.52 
 
 		 229 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  23.28 
 
 		 397 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 290 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.35 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  26.81 
 
 		 715 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  20.32 
 
 		 321 aa  44.3  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 681 aa  44.3  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  31.03 
 
 		 872 aa  43.9  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>