68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2278 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2278  carbon storage regulator  100 
 
 		 85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3470  carbon storage regulator  64 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1058  carbon storage regulator  66 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2417  carbon storage regulator, CsrA  55.32 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0439  carbon storage regulator, CsrA  50.79 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0246  carbon storage regulator, CsrA  55.1 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0714  carbon storage regulator  59.57 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0884  carbon storage regulator, CsrA  53.19 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0697  carbon storage regulator, CsrA  57.14 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000794724  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0062  carbon storage regulator  56.25 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0673  carbon storage regulator, CsrA  57.14 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0669  carbon storage regulator, CsrA  53.06 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0307434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1669  carbon storage regulator, CsrA  46.94 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1246  carbon storage regulator  63.27 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.215113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0619  carbon storage regulator  63.27 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.760679  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1121  carbon storage regulator  63.27 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0440  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  53.19 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0184  carbon storage regulator  46.94 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1973  carbon storage regulator  52.94 
 
 		 60 aa  50.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0211  carbon storage regulator, CsrA  53.06 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.363506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31000  carbon storage regulator CsrA  44.9 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1631  carbon storage regulator  44.9 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.635349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1147  global regulator protein CsrA  46.94 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0604  carbon storage regulator, CsrA  40.82 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2998  carbon storage regulator  45.83 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1511  carbon storage regulator, CsrA  48.98 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0099  carbon storage regulator, CsrA  46.81 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3041  carbon storage regulator  51.06 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2232  carbon storage regulator  51.02 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000917827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2401  carbon storage regulator, CsrA  35.59 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3026  carbon storage regulator  48.33 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2420  carbon storage regulator, CsrA  51.06 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2005  carbon storage regulator, CsrA  44.62 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2970  carbon storage regulator, CsrA  54.35 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4097  carbon storage regulator, CsrA  48.94 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3943  carbon storage regulator, putative  48.94 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3224  carbon storage regulator  42.47 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1478  carbon storage regulator, CsrA  40.74 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0019  carbon storage regulator, CsrA  33.77 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0309  carbon storage regulator, CsrA  51.06 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0697  carbon storage regulator  56 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0772  carbon storage regulator  42.55 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1588  carbon storage regulator, CsrA  44.07 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2239  carbon storage regulator, CsrA  48.28 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0196  carbon storage regulator  44 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17090  carbon storage regulator, CsrA  44.07 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2136  carbon storage regulator  42.19 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1912  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  41.38 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0207857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4191  carbon storage regulator, CsrA  41.38 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0311  carbon storage regulator  42.86 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2360  carbon storage regulator, CsrA  40.43 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5234  carbon storage regulator, CsrA  44.68 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0341  carbon storage regulator  48 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0614  carbon storage regulator, CsrA  42.86 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1296  carbon storage regulator, CsrA  44.68 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.760473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1338  carbon storage regulator, CsrA  42.55 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2387  regulatory protein  38 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3093  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  40.82 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3150  carbon storage regulator  38.3 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0750  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  46.81 
 
 		 77 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.708903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2526  carbon storage regulator, CsrA  38.3 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0992  carbon storage regulator, CsrA  42.55 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0885  carbon storage regulator  40.82 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.4873100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0992  carbon storage regulator  40.82 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000161482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1306  carbon storage regulator, CsrA  36.73 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1999  carbon storage regulator, CsrA  40.43 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2378  hypothetical protein  47.92 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1629  carbon storage regulator  36.17 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>