More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0599 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0599  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
393 aa  797    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.155589  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1767  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
395 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000492004  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
390 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
382 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24600  predicted protein  32.94 
 
 
413 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366572  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2617  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465254  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0888  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.14 
 
 
402 aa  156  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.867893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
395 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
387 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
414 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1485  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
407 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.593755  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 
396 aa  149  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1421  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2661  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
380 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1319  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
397 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.21 
 
 
388 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
383 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
384 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
371 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1199  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.33 
 
 
380 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0253  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.59 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.01 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1246  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404887  normal  0.363683 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1273  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
377 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
388 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.58 
 
 
376 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
388 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
385 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  28.68 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
389 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0534  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
378 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.0000192772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.11 
 
 
399 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.56 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02634  alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0492  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
384 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
385 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
378 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2942  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
385 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.85 
 
 
382 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0140  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
399 aa  133  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 
387 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
385 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
385 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
385 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.38 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003761  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0152546  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  29.41 
 
 
369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0904  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.18 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2279  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
385 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.61 
 
 
405 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
887 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.335105  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
872 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 
368 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
387 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0134  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
869 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  30.42 
 
 
382 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0139  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
869 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.880882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.42 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1734  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
373 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.12 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0198  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
370 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 
382 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  32.15 
 
 
383 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0379  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.08 
 
 
881 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2275  propanol dehydrogenase  27.22 
 
 
370 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229422 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1518  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
863 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000499783  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1248  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 
898 aa  127  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.621028  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
388 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>