More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2465 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0468  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  74.23 
 
 
175 aa  245  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1489  acetolactate synthase, small subunit  73.49 
 
 
171 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3010  acetolactate synthase, small subunit  70.66 
 
 
187 aa  241  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0785247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  70.91 
 
 
184 aa  240  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1781  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  73.58 
 
 
190 aa  239  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0627755  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.17 
 
 
180 aa  238  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2721  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.48 
 
 
180 aa  237  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.507095  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2342  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.26 
 
 
180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.26 
 
 
180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.7 
 
 
186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2636  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.62 
 
 
186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1293  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.62 
 
 
186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3344  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.1 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1172  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.37 
 
 
186 aa  230  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.920146  normal  0.661058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5446  acetolactate synthase, small subunit  67.47 
 
 
180 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.7 
 
 
190 aa  228  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554097  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2100  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
180 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2170  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  70.62 
 
 
186 aa  228  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578805  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 
180 aa  227  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.15 
 
 
164 aa  223  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.67 
 
 
171 aa  222  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.87 
 
 
172 aa  222  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.95 
 
 
190 aa  222  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5351  acetolactate synthase, small subunit  65.06 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4866  acetolactate synthase, small subunit  65.06 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5406  acetolactate synthase, small subunit  65.06 
 
 
180 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111863  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2801  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.94 
 
 
190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  64.46 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0238  acetolactate synthase, small subunit  64.46 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0204828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.88 
 
 
185 aa  218  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.46 
 
 
171 aa  217  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2790  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.94 
 
 
190 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0627176  normal  0.761903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2531  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.18 
 
 
190 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1805  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.72 
 
 
190 aa  215  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.673104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.54 
 
 
190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00968977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1345  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.54 
 
 
190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00225872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3353  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.74 
 
 
182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2262  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.84 
 
 
172 aa  211  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  57.41 
 
 
167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.56 
 
 
163 aa  171  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.94 
 
 
163 aa  169  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 
163 aa  168  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.09 
 
 
163 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.09 
 
 
163 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
165 aa  160  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.62 
 
 
163 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
168 aa  157  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  50.31 
 
 
164 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
163 aa  153  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 
163 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  50.94 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 
163 aa  151  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.06 
 
 
164 aa  147  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  45.86 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  48.77 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  48.77 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
159 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.83 
 
 
161 aa  145  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
166 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
166 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2375  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.85 
 
 
164 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0991612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2491  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.85 
 
 
164 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126247  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.75 
 
 
161 aa  143  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2387  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.85 
 
 
164 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474277  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.47 
 
 
163 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1972  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.85 
 
 
164 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0607984  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  48.75 
 
 
167 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.06 
 
 
163 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.17 
 
 
167 aa  142  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
163 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
163 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
163 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
163 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
163 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
163 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
163 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
163 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.73 
 
 
163 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  46.63 
 
 
164 aa  141  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  47.53 
 
 
164 aa  141  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3323  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  141  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.24 
 
 
164 aa  141  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  141  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
163 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.47 
 
 
163 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.47 
 
 
163 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>