50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1500 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  100 
 
 		 152 aa  311  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  42.67 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  38.85 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  40.88 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  32.39 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  37.23 
 
 		 197 aa  94.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  36.23 
 
 		 162 aa  90.5  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  37.14 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  40.15 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  35.07 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  38.17 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  30.66 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  32.41 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  35.29 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  32.41 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.41 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.58 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.03 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  33.33 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.33 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  31.72 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  34.31 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  31.79 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  30.82 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  31.79 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.88 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  31.79 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.33 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.33 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  30.14 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.33 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.99 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  27.74 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  26.15 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  30.15 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  27.74 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.52 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  25.18 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0430  FabA FabZ, FabA/Z, beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  26.67 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0473  hypothetical protein  29.73 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1486  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.62 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1077  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.08 
 
 		 176 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000662978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3424  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.08 
 
 		 176 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1024  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.08 
 
 		 176 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 497 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2659  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase  28.03 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1564  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.62 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.169629  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002758  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  27.34 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.941344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>