37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1138 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  100 
 
 		 134 aa  276  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  37.84 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  39.64 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  36.97 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.82 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  31.82 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.82 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2725  protein of unknown function DUF1486  28.35 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00391008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0903  limonene-1,2-epoxide hydrolase  36.73 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1913  limonene-12-epoxide hydrolase  33.91 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2174  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.4 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2115  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.4 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2128  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.4 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2578  Limonene-12-epoxide hydrolase  35.64 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  33.06 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5692  hypothetical protein  29.31 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  31.85 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  29.51 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  32.76 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  27.13 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5231  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.72 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.486907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  28.46 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  29.6 
 
 		 434 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18310  SnoaL-like polyketide cyclase  26.47 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2590  hypothetical protein  25.49 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  26.45 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  26.09 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  26.09 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  26.09 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3985  limonene-1,2-epoxide hydrolase  32.8 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.174553  normal  0.332359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2145  hypothetical protein  25 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4520  hypothetical protein  26.55 
 
 		 123 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38212  normal  0.255709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  25.78 
 
 		 137 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  27.05 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  23.33 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0811  Limonene-12-epoxide hydrolase  24.51 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1423  Limonene-12-epoxide hydrolase  29.6 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>