16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2590 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2590  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  259  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0811  Limonene-12-epoxide hydrolase  82.03 
 
 		 128 aa  222  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2589  hypothetical protein  62.81 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.744125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1913  limonene-12-epoxide hydrolase  42.19 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5231  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40.5 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.486907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2578  Limonene-12-epoxide hydrolase  35.2 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  44.44 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.33 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  29.17 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0903  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.71 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  43.86 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  43.86 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  25.95 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  25.49 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  43.86 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0357  limonene-1,2-epoxide hydrolase  21.84 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>