20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0811 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0811  Limonene-12-epoxide hydrolase  100 
 
 
128 aa  258  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333628  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2590  hypothetical protein  82.03 
 
 
128 aa  222  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2589  hypothetical protein  64.52 
 
 
130 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1913  limonene-12-epoxide hydrolase  46.34 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5231  limonene-1,2-epoxide hydrolase  38.02 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.486907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2578  Limonene-12-epoxide hydrolase  37.29 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662459  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  42.42 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0357  limonene-1,2-epoxide hydrolase  27.59 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  29.41 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0903  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.96 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  47.92 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  32.56 
 
 
149 aa  42.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  47.92 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  47.92 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2174  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.76 
 
 
149 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.33 
 
 
124 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2115  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.76 
 
 
149 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2128  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.76 
 
 
149 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2535  Limonene-12-epoxide hydrolase  32.61 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.253274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  24.51 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>